Bioinformaticus Productie & Support

Solliciteer direct

Jouw functie

De sectie Genoomdiagnostiek van de afdeling Genetica in het Radboudumc ambieert om voorop te blijven lopen op het gebied van genetische patiëntendiagnostiek. Hierbij worden de nieuwste technieken binnen het vakgebied van de genetica ingezet. We werken met moderne technologieën om DNA te onderzoeken: van geavanceerde methoden om DNA uit te lezen tot slimme algoritmes voor het opsporen van genetische varianten en software die helpt bij de interpretatie daarvan.

Onze processen zijn sterk geautomatiseerd; zowel in het natte lab (aansturing van pipetteerrobots) als in het analyseren van grote hoeveelheden data (bio-informatica) en de interpretatie van de resultaten. Dagelijks verwerken wij ongeveer 150 DNA‑samples met behulp van meerdere moderne onderzoeksmethoden.

Als bioinformaticus Productie & Support ben jij verantwoordelijk voor de dagelijkse verwerking van de samples via onze geautomatiseerde pipelines die draaien op ons omvangrijke rekencluster.

Wat ga je doen? De data die wordt geproduceerd door onze short- en long‑read sequencers komt binnen op ons centrale HPC‑systeem (6 PB opslag, 1448 CPU‑cores) en wordt daar automatisch opgepakt door de pipelines die door het gehele team Bio‑informatica worden ontwikkeld.

Samen met jouw vier collega’s in het team Productie & Support werk je aan:

  • Het monitoren en handmatig bijsturen van dit productieproces in het geval van verstoringen
  • Het aanbrengen van verbeteringen en nieuwe functionaliteiten in dit geautomatiseerde proces (ondersteund door collega’s van onze softwareontwikkelaars of collega‑bioinformatici)
  • Het beantwoorden van technische, logistieke of inhoudelijke vragen van onze collega’s op het laboratorium of van de inhoudelijke interpretatie (moleculair geneticus)

Wat maakt je werk bijzonder? Je werkt in een omgeving waar laboratoriumprocessen, patiëntenzorg, complexe algoritmen en enorme hoeveelheden data samenkomen. Jouw werk draagt direct bij aan een diagnose of de keuze voor een behandelmethode. Dit heeft een grote impact op de gezondheid van onze patiënten.

In deze positie is er veel ruimte voor zelfstandig werken, waarbij je juist ook afstemming zoekt met jouw directe collega’s binnen het team Bio‑informatica en indirecte collega’s binnen onze sectie Genoomdiagnostiek.

Jouw werkplek

De afdeling Genetica voert poliklinische behandelingen en diagnostiek van erfelijke ziekten uit en is daarmee een van de grootste genetica‑afdelingen in Europa. De onderzoeksgroepen verrichten baanbrekend onderzoek naar de relatie tussen genen en ziekten, in het bijzonder kanker, doofheid, blindheid, verstandelijke beperking en aangeboren afwijkingen.

Binnen deze afdeling is de sectie Genoomdiagnostiek een ISO 15189:2012‑gecertificeerd laboratorium dat hoogwaardige genetische diagnostiek verzorgt voor patiënten en hun families. Dit wordt gedaan door ruim 170 medewerkers, die jaarlijks meer dan 30.000 genetische tests uitvoeren voor meer dan 600 genetische aandoeningen, met behulp van de nieuwste innovatieve genetische technieken.

Het team Bio‑informatica (15 personen) is verantwoordelijk voor de ontwikkeling en uitvoering van de databewerking via geautomatiseerde pipelines. Dit team is verder onderverdeeld in de groepen Innovatie (nieuwe technieken), Research Support, Metabole Diagnostiek en Productie & Support.

Daarnaast wordt nauw samengewerkt met het team LabICT op het gebied van softwareontwikkeling en met onze collega’s in het MUMC+, met wie wij de infrastructuur delen (negen collega’s aldaar).

De succesfactor in onze organisatie ligt in de multidisciplinaire samenwerking, zowel binnen het team (innovatie, automatisering, productie & support), als binnen onze sectie (het natte lab, bio‑informatica en interpretatie) en daarbuiten (research, kliniek en andere afdelingen zoals pathologie en medische microbiologie).

Jouw profiel

Je hebt een hbo‑opleiding (bachelor of master) in de bio‑informatica (of vergelijkbaar), met een sterke nadruk op de humane genetica.

Er is veel vrijheid en verantwoordelijkheid in deze functie, wat vraagt om een gestructureerde en zorgvuldige manier van werken, met aandacht voor detail. Daarnaast ben je in staat om jouw werkzaamheden in te passen in het grotere geheel. Je hebt de discipline om het geautomatiseerde proces te ondersteunen én de creativiteit en durf om hierin verbeteringen aan te brengen. Veranderingen of nieuwe concepten pak je snel op. Het internationale karakter van ons team vraagt om een goede beheersing van de Engelse taal.

Je hebt (basis)kennis van:

  • Java of een andere objectgeoriënteerde programmeertaal.
  • (Geautomatiseerde) bio‑informatica‑pipelines.
  • Snakemake; kennis van Nextflow is een pre.
  • Het vakgebied van de bio‑informatica binnen de (humane) genetica.

Je wilt je verder ontwikkelen in:

  • Het programmeren aan geautomatiseerde pipelines.
  • Het zelfstandig doorvoeren van veranderingen, in samenwerking met collega’s binnen en buiten het team Bio‑informatica

En je past goed bij onze werkomgeving als je:

  • Je werkzaamheden zelfstandig kunt uitvoeren.
  • In staat bent om verbeteringen uit te dragen binnen het grotere geheel.

Onze academische en open werkomgeving geeft je veel ruimte: je bent verantwoordelijk voor je eigen werk. Daarom zoeken we iemand die eigenaarschap toont, initiatief neemt en energie krijgt van betekenisvol werk binnen de zorg.

Goed om te weten

  • Voor deze functie is een Verklaring Omtrent het Gedrag (VOG) vereist.

Meer weten?

We vertellen je graag meer! 

Steven Castelein

024 366 89 40

Fijne arbeidsvoorwaarden

Denk verder

Werk anders

Bij het Radboudumc bouw je aan de toekomst. Of je hart nu ligt bij zorg, onderzoek of onderwijs, bij ons kom je verder. We gaan voor de beste zorg. Ben jij er nu klaar om verder te denken en anders te werken? 

De sollicitatieprocedure

Loop jouw droombaan bij Radboudumc niet mis!

Laat je gegevens achter en wij houden je op de hoogte van onze nieuwe vacatures.